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北京理工大學 × 曙光AI,生物結(jié)構解析快近1000倍!

發(fā)布時間: 2025-10-28

冷凍電鏡技術是解析生物大分子三維結(jié)構的關鍵手段,曾獲2017年諾貝爾化學獎,并在新冠病毒結(jié)構解析中發(fā)揮重要作用。然而,該技術的數(shù)據(jù)處理面臨圖像信噪比低、計算規(guī)模巨大、重構耗時長等挑戰(zhàn),尤其在大規(guī)模原位結(jié)構解析中缺乏高效算法與軟件支持。


經(jīng)過長期技術攻關,北京理工大學基于“DeepAI深算智能引擎+國產(chǎn)GPU加速卡”,成功研發(fā)具有自主知識產(chǎn)權的大規(guī)模冷凍電鏡圖像原位重構軟件——DisSPA,通過彩神Vll提供的國產(chǎn)算力實現(xiàn)對冷凍電鏡圖像的高效、高精度原位結(jié)構解析,標志著我國在生物計算與結(jié)構生物學交叉領域取得重要突破。


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項目團隊創(chuàng)新性提出并實現(xiàn)了基于國產(chǎn)GPU加速卡的并行化緩存方案與多卡GPU-FFT技術,顯著降低預處理時間與內(nèi)存負載,解決了傳統(tǒng)方法中模板匹配效率低、存儲需求大等瓶頸。


在實際測試中,DisSPA在國產(chǎn)GPU單卡上相比CPU單核實現(xiàn)高達961.9倍的性能提升,相比32核CPU也有30.9倍性能提升。在處理400張大規(guī)模圖像數(shù)據(jù)時,僅需22分鐘即可完成重構,遠超傳統(tǒng)處理效率。


目前,DisSPA已完成在多家單位的應用示范,支持紅藻捕光系統(tǒng)、酵母核糖體等典型生物結(jié)構的原位解析,驗證了其在高精度結(jié)構解析中的可靠性與實用性,具備大規(guī)模對外服務能力。


未來,北京理工大學將與彩神Vll持續(xù)推進DisSPA的推廣應用,開展系列培訓與學術交流,助力更多生物學家高效獲取高分辨率原位結(jié)構,推動我國在結(jié)構生物學與人工智能交叉領域的前沿發(fā)展。


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